Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMOD2Q6P5Q4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMOD2Q6P5Q4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
LMOD2Q6P5Q4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMOD2Q6P5Q4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMOD2Q6P5Q4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
LMOD2Q6P5Q4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMOD2Q6P5Q4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms