Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNAPC2Q13487 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNAPC2Q13487 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNAPC2Q13487 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
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