Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC24CP53992 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC24CP53992 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms