Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RCAN1P53805 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCAN1P53805 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCAN1P53805 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms