Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYL1P12980 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYL1P12980 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYL1P12980 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYL1P12980 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LYL1P12980 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYL1P12980 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYL1P12980 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYL1P12980 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LYL1P12980 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYL1P12980 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYL1P12980 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYL1P12980 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYL1P12980 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYL1P12980 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYL1P12980 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYL1P12980 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYL1P12980 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYL1P12980 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYL1P12980 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYL1P12980 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LYL1P12980 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYL1P12980 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYL1P12980 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYL1P12980 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYL1P12980 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYL1P12980 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYL1P12980 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYL1P12980 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYL1P12980 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYL1P12980 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYL1P12980 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYL1P12980 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LYL1P12980 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYL1P12980 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYL1P12980 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYL1P12980 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYL1P12980 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYL1P12980 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYL1P12980 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYL1P12980 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYL1P12980 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYL1P12980 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYL1P12980 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LYL1P12980 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LYL1P12980 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LYL1P12980 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LYL1P12980 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYL1P12980 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYL1P12980 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYL1P12980 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LYL1P12980 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYL1P12980 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYL1P12980 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYL1P12980 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LYL1P12980 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LYL1P12980 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LYL1P12980 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LYL1P12980 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LYL1P12980 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LYL1P12980 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LYL1P12980 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LYL1P12980 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LYL1P12980 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LYL1P12980 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LYL1P12980 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LYL1P12980 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LYL1P12980 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LYL1P12980 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LYL1P12980 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LYL1P12980 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LYL1P12980 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LYL1P12980 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LYL1P12980 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LYL1P12980 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LYL1P12980 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LYL1P12980 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LYL1P12980 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LYL1P12980 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LYL1P12980 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LYL1P12980 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LYL1P12980 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LYL1P12980 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LYL1P12980 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LYL1P12980 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LYL1P12980 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LYL1P12980 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LYL1P12980 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LYL1P12980 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LYL1P12980 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LYL1P12980 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LYL1P12980 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LYL1P12980 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LYL1P12980 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LYL1P12980 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LYL1P12980 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LYL1P12980 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LYL1P12980 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LYL1P12980 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LYL1P12980 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms