Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL0

RCOR1, REST corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR1Q9UKL0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RCOR1Q9UKL0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCOR1Q9UKL0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms