Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CYTH4Q9UIA0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTH4Q9UIA0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms