Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLIC6Q96NY7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIC6Q96NY7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms