Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDDC3Q8N4P3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDDC3Q8N4P3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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