Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDXQ7Z353 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDXQ7Z353 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HDXQ7Z353 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDXQ7Z353 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDXQ7Z353 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDXQ7Z353 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDXQ7Z353 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
HDXQ7Z353 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDXQ7Z353 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
HDXQ7Z353 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDXQ7Z353 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDXQ7Z353 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDXQ7Z353 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDXQ7Z353 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDXQ7Z353 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDXQ7Z353 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDXQ7Z353 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDXQ7Z353 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDXQ7Z353 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDXQ7Z353 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDXQ7Z353 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HDXQ7Z353 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDXQ7Z353 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDXQ7Z353 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDXQ7Z353 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDXQ7Z353 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDXQ7Z353 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDXQ7Z353 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 307.7 ms