Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNA1Q09470 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms