Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LYVE1Q9Y5Y7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms