Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB6Q9Y5E3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB6Q9Y5E3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms