Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2C9

TLR6, Toll-like receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR6Q9Y2C9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLR6Q9Y2C9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TLR6Q9Y2C9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms