Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRP68Q9UHB9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRP68Q9UHB9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms