Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP47Q5SQN1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP47Q5SQN1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms