Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2C1P98194 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2C1P98194 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms