Protein–RNA interactions for Protein: P20273

CD22, B-cell receptor CD22, humanhuman

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD22P20273 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD22P20273 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD22P20273 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD22P20273 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD22P20273 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD22P20273 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD22P20273 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD22P20273 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD22P20273 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD22P20273 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD22P20273 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD22P20273 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD22P20273 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD22P20273 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD22P20273 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD22P20273 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD22P20273 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD22P20273 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD22P20273 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD22P20273 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD22P20273 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD22P20273 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD22P20273 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD22P20273 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD22P20273 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD22P20273 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD22P20273 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CD22P20273 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD22P20273 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD22P20273 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD22P20273 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD22P20273 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD22P20273 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD22P20273 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD22P20273 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD22P20273 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CD22P20273 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CD22P20273 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD22P20273 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD22P20273 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD22P20273 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD22P20273 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD22P20273 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD22P20273 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD22P20273 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD22P20273 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD22P20273 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD22P20273 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD22P20273 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD22P20273 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD22P20273 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD22P20273 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD22P20273 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD22P20273 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD22P20273 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD22P20273 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CD22P20273 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD22P20273 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD22P20273 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD22P20273 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD22P20273 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD22P20273 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD22P20273 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD22P20273 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD22P20273 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD22P20273 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD22P20273 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD22P20273 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD22P20273 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD22P20273 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD22P20273 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD22P20273 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD22P20273 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD22P20273 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD22P20273 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CD22P20273 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CD22P20273 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD22P20273 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD22P20273 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD22P20273 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD22P20273 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD22P20273 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD22P20273 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD22P20273 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD22P20273 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD22P20273 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD22P20273 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD22P20273 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD22P20273 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD22P20273 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD22P20273 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD22P20273 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD22P20273 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD22P20273 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD22P20273 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CD22P20273 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD22P20273 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD22P20273 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD22P20273 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD22P20273 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms