Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SHARPINQ9H0F6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHARPINQ9H0F6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms