Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E2Q96LR5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E2Q96LR5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E2Q96LR5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E2Q96LR5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E2Q96LR5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E2Q96LR5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E2Q96LR5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E2Q96LR5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E2Q96LR5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E2Q96LR5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E2Q96LR5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E2Q96LR5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E2Q96LR5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E2Q96LR5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBE2E2Q96LR5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE2E2Q96LR5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBE2E2Q96LR5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBE2E2Q96LR5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms