Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HIF1AQ16665 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HIF1AQ16665 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIF1AQ16665 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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