Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH15P55291 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH15P55291 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH15P55291 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH15P55291 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH15P55291 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH15P55291 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH15P55291 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH15P55291 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH15P55291 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH15P55291 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH15P55291 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH15P55291 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH15P55291 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH15P55291 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH15P55291 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH15P55291 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH15P55291 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH15P55291 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH15P55291 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH15P55291 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH15P55291 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH15P55291 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH15P55291 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH15P55291 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH15P55291 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH15P55291 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH15P55291 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH15P55291 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH15P55291 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH15P55291 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH15P55291 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH15P55291 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH15P55291 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH15P55291 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH15P55291 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH15P55291 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH15P55291 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH15P55291 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH15P55291 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH15P55291 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH15P55291 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH15P55291 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH15P55291 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH15P55291 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH15P55291 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH15P55291 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH15P55291 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH15P55291 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH15P55291 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH15P55291 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH15P55291 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH15P55291 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH15P55291 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH15P55291 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH15P55291 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH15P55291 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH15P55291 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH15P55291 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH15P55291 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH15P55291 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH15P55291 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH15P55291 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH15P55291 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH15P55291 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH15P55291 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH15P55291 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH15P55291 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH15P55291 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH15P55291 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH15P55291 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH15P55291 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH15P55291 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH15P55291 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH15P55291 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH15P55291 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH15P55291 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH15P55291 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH15P55291 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH15P55291 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH15P55291 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH15P55291 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH15P55291 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH15P55291 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH15P55291 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH15P55291 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH15P55291 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH15P55291 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH15P55291 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH15P55291 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH15P55291 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH15P55291 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH15P55291 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH15P55291 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH15P55291 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH15P55291 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH15P55291 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH15P55291 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH15P55291 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH15P55291 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms