Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPA3P35244 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPA3P35244 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPA3P35244 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPA3P35244 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPA3P35244 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPA3P35244 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPA3P35244 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPA3P35244 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPA3P35244 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPA3P35244 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPA3P35244 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPA3P35244 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPA3P35244 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPA3P35244 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPA3P35244 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPA3P35244 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPA3P35244 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPA3P35244 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA3P35244 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA3P35244 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA3P35244 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA3P35244 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA3P35244 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA3P35244 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA3P35244 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA3P35244 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA3P35244 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA3P35244 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPA3P35244 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPA3P35244 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPA3P35244 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPA3P35244 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPA3P35244 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPA3P35244 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPA3P35244 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPA3P35244 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPA3P35244 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPA3P35244 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPA3P35244 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPA3P35244 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPA3P35244 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPA3P35244 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPA3P35244 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPA3P35244 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPA3P35244 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPA3P35244 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPA3P35244 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPA3P35244 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA3P35244 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA3P35244 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA3P35244 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA3P35244 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA3P35244 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA3P35244 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA3P35244 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA3P35244 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA3P35244 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA3P35244 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA3P35244 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA3P35244 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA3P35244 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPA3P35244 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPA3P35244 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPA3P35244 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPA3P35244 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPA3P35244 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPA3P35244 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPA3P35244 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPA3P35244 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPA3P35244 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPA3P35244 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPA3P35244 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPA3P35244 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPA3P35244 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPA3P35244 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPA3P35244 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA3P35244 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA3P35244 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA3P35244 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA3P35244 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA3P35244 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA3P35244 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA3P35244 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA3P35244 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA3P35244 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA3P35244 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA3P35244 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA3P35244 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA3P35244 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA3P35244 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA3P35244 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA3P35244 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA3P35244 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA3P35244 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA3P35244 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA3P35244 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA3P35244 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA3P35244 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA3P35244 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms