Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 CXXC5-203ENST00000502336 581 ntTSL 422■■□□□ 1.115e-8■■■■■ 34.1
DKC1O60832 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.855e-8■■■■■ 34.1
DKC1O60832 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.725e-8■■■■■ 34.1
DKC1O60832 CXXC5-214ENST00000512816 558 ntTSL 318.69■□□□□ 0.585e-8■■■■■ 34.1
DKC1O60832 CXXC5-202ENST00000502295 503 ntTSL 418.37■□□□□ 0.535e-8■■■■■ 34.1
DKC1O60832 CXXC5-216ENST00000520967 878 ntTSL 317.72■□□□□ 0.435e-8■■■■■ 34.1
DKC1O60832 CXXC5-207ENST00000504944 568 ntTSL 315.98■□□□□ 0.155e-8■■■■■ 34.1
DKC1O60832 IL1R1-203ENST00000409589 3544 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.682e-8■■■■■ 34
DKC1O60832 IL1R1-208ENST00000424272 2658 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.962e-8■■■■■ 34
DKC1O60832 IL1R1-213ENST00000452403 609 ntTSL 36.88□□□□□ -1.312e-8■■■■■ 34
DKC1O60832 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.342e-8■■■■■ 34
DKC1O60832 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.52e-8■■■■■ 34
DKC1O60832 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.039e-7■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-206ENST00000524500 573 ntTSL 421.2■□□□□ 0.984e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-233ENST00000534636 633 ntTSL 420.74■□□□□ 0.914e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-222ENST00000531551 1855 ntTSL 1 (best)19.75■□□□□ 0.754e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.714e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-229ENST00000533572 975 ntTSL 319.29■□□□□ 0.684e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-226ENST00000532656 573 ntTSL 419.17■□□□□ 0.664e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.614e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.64e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-210ENST00000526195 560 ntTSL 418.07■□□□□ 0.484e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-213ENST00000527215 545 ntTSL 418.05■□□□□ 0.484e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.464e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-215ENST00000528965 556 ntTSL 317.56■□□□□ 0.44e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.44e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.374e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.364e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-208ENST00000525076 550 ntTSL 517.03■□□□□ 0.324e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-230ENST00000534149 524 ntTSL 416.66■□□□□ 0.264e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-224ENST00000532392 570 ntTSL 416.31■□□□□ 0.24e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-231ENST00000534382 764 ntTSL 416.31■□□□□ 0.24e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-221ENST00000531502 557 ntTSL 416.08■□□□□ 0.164e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-217ENST00000530296 561 ntTSL 415.84■□□□□ 0.134e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-214ENST00000527243 580 ntTSL 412.56□□□□□ -0.44e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-207ENST00000524654 368 ntTSL 512.32□□□□□ -0.444e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-212ENST00000526645 559 ntTSL 412.06□□□□□ -0.484e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CTSB-205ENST00000505496 540 ntTSL 49.78□□□□□ -0.844e-14■■■■■ 34
DKC1O60832 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.591e-20■■■■■ 34
DKC1O60832 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.231e-6■■■■■ 33.9
DKC1O60832 ASMTL-AS1-201ENST00000419737 553 ntTSL 215.05■□□□□ -01e-6■■■■■ 33.9
DKC1O60832 ASMTL-AS1-205ENST00000602357 435 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 33.9
DKC1O60832 ASMTL-AS1-202ENST00000420411 697 ntTSL 1 (best)12.37□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 33.9
DKC1O60832 SRCIN1-216ENST00000621763 5225 ntTSL 219.56■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 33.8
DKC1O60832 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.67e-9■■■■■ 33.8
DKC1O60832 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.287e-9■■■■■ 33.8
DKC1O60832 BCAR1-218ENST00000566982 3024 ntTSL 216.55■□□□□ 0.247e-9■■■■■ 33.8
DKC1O60832 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.177e-9■■■■■ 33.8
DKC1O60832 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.157e-9■■■■■ 33.8
DKC1O60832 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.147e-9■■■■■ 33.8
DKC1O60832 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.057e-9■■■■■ 33.8
DKC1O60832 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.037e-9■■■■■ 33.8
DKC1O60832 BCAR1-211ENST00000562556 4659 ntTSL 214.62□□□□□ -0.077e-9■■■■■ 33.8
DKC1O60832 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.277e-9■■■■■ 33.8
DKC1O60832 ANKRD11-211ENST00000566973 442 ntTSL 222.72■■□□□ 1.235e-11■■■■■ 33.7
DKC1O60832 ANKRD11-215ENST00000568512 294 ntTSL 210.06□□□□□ -0.85e-11■■■■■ 33.7
DKC1O60832 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.645e-7■■■■■ 33.7
DKC1O60832 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.385e-7■■■■■ 33.7
DKC1O60832 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.523e-6■■■■■ 33.7
DKC1O60832 NGEF-206ENST00000420650 519 ntTSL 515.2■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 33.7
DKC1O60832 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.92e-74■■■■■ 33.6
DKC1O60832 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.472e-74■■■■■ 33.6
DKC1O60832 KANSL2-206ENST00000548147 1514 ntTSL 210.42□□□□□ -0.742e-74■■■■■ 33.6
DKC1O60832 KANSL2-201ENST00000420613 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.872e-74■■■■■ 33.6
DKC1O60832 KANSL2-202ENST00000546701 1881 ntTSL 28.97□□□□□ -0.972e-74■■■■■ 33.6
DKC1O60832 KANSL2-211ENST00000549574 1625 ntTSL 58.53□□□□□ -1.042e-74■■■■■ 33.6
DKC1O60832 KANSL2-203ENST00000547087 831 ntTSL 37.61□□□□□ -1.192e-74■■■■■ 33.6
DKC1O60832 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.283e-10■■■■■ 33.5
DKC1O60832 DDX19A-213ENST00000569319 1643 ntTSL 1 (best)16.47■□□□□ 0.233e-10■■■■■ 33.5
DKC1O60832 DDX19A-215ENST00000575878 1533 ntTSL 215.42■□□□□ 0.063e-10■■■■■ 33.5
DKC1O60832 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.053e-10■■■■■ 33.5
DKC1O60832 DDX19A-209ENST00000566574 5007 ntTSL 1 (best)13.08□□□□□ -0.323e-10■■■■■ 33.5
DKC1O60832 DDX19A-201ENST00000302243 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.463e-10■■■■■ 33.5
DKC1O60832 AC012184.2-201ENST00000565116 565 ntTSL 511.34□□□□□ -0.593e-10■■■■■ 33.5
DKC1O60832 DDX19A-214ENST00000569771 3067 ntTSL 1 (best)11.25□□□□□ -0.613e-10■■■■■ 33.5
DKC1O60832 DDX19A-204ENST00000562140 3121 ntTSL 510.98□□□□□ -0.653e-10■■■■■ 33.5
DKC1O60832 DDX19A-210ENST00000567012 1178 ntTSL 1 (best)10.11□□□□□ -0.793e-10■■■■■ 33.5
DKC1O60832 AC012184.2-202ENST00000567706 867 ntTSL 510.01□□□□□ -0.813e-10■■■■■ 33.5
DKC1O60832 DDX19A-211ENST00000568779 730 ntTSL 27.73□□□□□ -1.173e-10■■■■■ 33.5
DKC1O60832 RPS13-209ENST00000533969 355 ntTSL 315.39■□□□□ 0.053e-43■■■■■ 33.5
DKC1O60832 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.72□□□□□ -1.973e-43■■■■■ 33.5
DKC1O60832 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.013e-15■■■■■ 33.4
DKC1O60832 TSR1-203ENST00000575049 387 ntTSL 35.59□□□□□ -1.513e-15■■■■■ 33.4
DKC1O60832 CYFIP1-206ENST00000613006 544 ntTSL 414.97□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 33.3
DKC1O60832 CYFIP1-209ENST00000619037 575 ntTSL 414.64□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 33.3
DKC1O60832 CYFIP1-204ENST00000611832 582 ntTSL 214.16□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 33.3
DKC1O60832 CYFIP1-203ENST00000610365 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 33.3
DKC1O60832 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.852e-7■■■■■ 33.3
DKC1O60832 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.662e-6■■■■■ 33.3
DKC1O60832 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.662e-6■■■■■ 33.3
DKC1O60832 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.622e-6■■■■■ 33.3
DKC1O60832 KRTAP5-AS1-202ENST00000524947 570 ntTSL 422.21■■□□□ 1.159e-14■■■■■ 33.3
DKC1O60832 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 33.3
DKC1O60832 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.019e-14■■■■■ 33.3
DKC1O60832 KRTAP5-AS1-204ENST00000534077 409 ntTSL 320.81■□□□□ 0.929e-14■■■■■ 33.3
DKC1O60832 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 33.3
DKC1O60832 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 33.3
DKC1O60832 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 33.3
DKC1O60832 PRKN-207ENST00000479615 904 ntTSL 516.98■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 33.3
DKC1O60832 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 33.3
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