RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619037.1

CYFIP1-209, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene CYFIP1, Length 575 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-209ENST00000619037 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.28■■■□□ 2.6
CYFIP1-209ENST00000619037 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.7■■■□□ 2.02
CYFIP1-209ENST00000619037 ABCC9O60706 1549 aa26.91■■□□□ 1.9
CYFIP1-209ENST00000619037 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.11■■□□□ 1.77
CYFIP1-209ENST00000619037 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CYFIP1-209ENST00000619037 NACADO15069 1562 aa25.97■■□□□ 1.75
CYFIP1-209ENST00000619037 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.95■■□□□ 1.75
CYFIP1-209ENST00000619037 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.85■■□□□ 1.73
CYFIP1-209ENST00000619037 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.84■■□□□ 1.73
CYFIP1-209ENST00000619037 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.42■■□□□ 1.66
CYFIP1-209ENST00000619037 SCRIBQ14160 1630 aa25.34■■□□□ 1.65
CYFIP1-209ENST00000619037 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
CYFIP1-209ENST00000619037 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.18■■□□□ 1.62
CYFIP1-209ENST00000619037 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.94■■□□□ 1.58
CYFIP1-209ENST00000619037 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CYFIP1-209ENST00000619037 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.48■■□□□ 1.51
CYFIP1-209ENST00000619037 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.38■■□□□ 1.49
CYFIP1-209ENST00000619037 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.34■■□□□ 1.49
CYFIP1-209ENST00000619037 SMARCA4P51532 1647 aa24.24■■□□□ 1.47
CYFIP1-209ENST00000619037 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CYFIP1-209ENST00000619037 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.14■■□□□ 1.45
CYFIP1-209ENST00000619037 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.02■■□□□ 1.44
CYFIP1-209ENST00000619037 SMARCA2P51531 1590 aa23.99■■□□□ 1.43
CYFIP1-209ENST00000619037 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.95■■□□□ 1.43
CYFIP1-209ENST00000619037 NCAPD3P42695 1498 aa23.95■■□□□ 1.42
CYFIP1-209ENST00000619037 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
CYFIP1-209ENST00000619037 WIZO95785 1651 aa23.92■■□□□ 1.42
CYFIP1-209ENST00000619037 HMGXB3Q12766 1538 aa23.86■■□□□ 1.41
CYFIP1-209ENST00000619037 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CYFIP1-209ENST00000619037 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CYFIP1-209ENST00000619037 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CYFIP1-209ENST00000619037 NESP48681 1621 aa23.37■■□□□ 1.33
CYFIP1-209ENST00000619037 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.36■■□□□ 1.33
CYFIP1-209ENST00000619037 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.3■■□□□ 1.32
CYFIP1-209ENST00000619037 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.28■■□□□ 1.32
CYFIP1-209ENST00000619037 CFTRP13569 1480 aa23.19■■□□□ 1.3
CYFIP1-209ENST00000619037 ERCC6Q03468 1493 aa23.16■■□□□ 1.3
CYFIP1-209ENST00000619037 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.12■■□□□ 1.29
CYFIP1-209ENST00000619037 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.11■■□□□ 1.29
CYFIP1-209ENST00000619037 PRDM2Q13029 1718 aa23.07■■□□□ 1.28
CYFIP1-209ENST00000619037 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.04■■□□□ 1.28
CYFIP1-209ENST00000619037 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.98■■□□□ 1.27
CYFIP1-209ENST00000619037 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CYFIP1-209ENST00000619037 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.89■■□□□ 1.25
CYFIP1-209ENST00000619037 WDR62O43379 1518 aa22.8■■□□□ 1.24
CYFIP1-209ENST00000619037 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CYFIP1-209ENST00000619037 CUX2O14529 1486 aa22.79■■□□□ 1.24
CYFIP1-209ENST00000619037 TOPBP1Q92547 1522 aa22.7■■□□□ 1.22
CYFIP1-209ENST00000619037 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.68■■□□□ 1.22
CYFIP1-209ENST00000619037 ABCC8Q09428 1581 aa22.67■■□□□ 1.22
CYFIP1-209ENST00000619037 CUX1P39880 1505 aa22.63■■□□□ 1.21
CYFIP1-209ENST00000619037 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
CYFIP1-209ENST00000619037 SYNJ1O43426 1573 aa22.52■■□□□ 1.2
CYFIP1-209ENST00000619037 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CYFIP1-209ENST00000619037 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.52■■□□□ 1.2
CYFIP1-209ENST00000619037 TOP2BQ02880 1626 aa22.49■■□□□ 1.19
CYFIP1-209ENST00000619037 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.49■■□□□ 1.19
CYFIP1-209ENST00000619037 IFT140Q96RY7 1462 aa22.47■■□□□ 1.19
CYFIP1-209ENST00000619037 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.45■■□□□ 1.18
CYFIP1-209ENST00000619037 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CYFIP1-209ENST00000619037 SOGA1O94964 1423 aa22.43■■□□□ 1.18
CYFIP1-209ENST00000619037 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CYFIP1-209ENST00000619037 WDR97A6NE52 1622 aa22.32■■□□□ 1.16
CYFIP1-209ENST00000619037 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CYFIP1-209ENST00000619037 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
CYFIP1-209ENST00000619037 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CYFIP1-209ENST00000619037 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.27■■□□□ 1.16
CYFIP1-209ENST00000619037 TRIM41Q8WV44 630 aa22.21■■□□□ 1.15
CYFIP1-209ENST00000619037 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.19■■□□□ 1.14
CYFIP1-209ENST00000619037 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.17■■□□□ 1.14
CYFIP1-209ENST00000619037 PBRM1Q86U86 1689 aa22.15■■□□□ 1.14
CYFIP1-209ENST00000619037 GRIN2BQ13224 1484 aa22.13■■□□□ 1.13
CYFIP1-209ENST00000619037 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.1■■□□□ 1.13
CYFIP1-209ENST00000619037 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.09■■□□□ 1.13
CYFIP1-209ENST00000619037 KIF27Q86VH2 1401 aa22.06■■□□□ 1.12
CYFIP1-209ENST00000619037 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CYFIP1-209ENST00000619037 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.01■■□□□ 1.11
CYFIP1-209ENST00000619037 CHD1O14646 1710 aa22■■□□□ 1.11
CYFIP1-209ENST00000619037 FBLN2P98095 1184 aa22■■□□□ 1.11
CYFIP1-209ENST00000619037 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.99■■□□□ 1.11
CYFIP1-209ENST00000619037 ADAMTS12P58397 1594 aa21.96■■□□□ 1.11
CYFIP1-209ENST00000619037 SYNJ2O15056 1496 aa21.95■■□□□ 1.1
CYFIP1-209ENST00000619037 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
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CYFIP1-209ENST00000619037 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.91■■□□□ 1.1
CYFIP1-209ENST00000619037 OSCARQ8IYS5 282 aa21.91■■□□□ 1.1
CYFIP1-209ENST00000619037 CUL7Q14999 1698 aa21.88■■□□□ 1.09
CYFIP1-209ENST00000619037 GRIN2AQ12879 1464 aa21.85■■□□□ 1.09
CYFIP1-209ENST00000619037 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.83■■□□□ 1.08
CYFIP1-209ENST00000619037 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.81■■□□□ 1.08
CYFIP1-209ENST00000619037 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CYFIP1-209ENST00000619037 EEA1Q15075 1411 aa21.78■■□□□ 1.08
CYFIP1-209ENST00000619037 CEP170Q5SW79 1584 aa21.75■■□□□ 1.07
CYFIP1-209ENST00000619037 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.75■■□□□ 1.07
CYFIP1-209ENST00000619037 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.73■■□□□ 1.07
CYFIP1-209ENST00000619037 NUP160Q12769 1436 aa21.72■■□□□ 1.07
CYFIP1-209ENST00000619037 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.72■■□□□ 1.07
CYFIP1-209ENST00000619037 PRXQ9BXM0 1461 aa21.69■■□□□ 1.06
CYFIP1-209ENST00000619037 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.58■■□□□ 1.04
CYFIP1-209ENST00000619037 ARHGEF11O15085 1522 aa21.57■■□□□ 1.04
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