Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E8

PCDHB15, Protocadherin beta-15, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB15Q9Y5E8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB15Q9Y5E8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB15Q9Y5E8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms