Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
TNIKQ9UKE5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TNIKQ9UKE5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TNIKQ9UKE5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms