Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP85Q9BW27 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP85Q9BW27 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP85Q9BW27 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.1 ms