Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RBM42Q9BTD8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms