Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR4

STAG3L4, Putative STAG3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L4Q8TBR4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STAG3L4Q8TBR4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STAG3L4Q8TBR4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms