Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC00301Q8NCQ3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LINC00301Q8NCQ3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 616.2 ms