Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK5Q00535 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.8 ms