Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMB2P55268 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMB2P55268 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms