Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS1P54277 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS1P54277 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS1P54277 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS1P54277 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS1P54277 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PMS1P54277 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMS1P54277 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMS1P54277 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMS1P54277 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PMS1P54277 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PMS1P54277 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMS1P54277 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMS1P54277 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMS1P54277 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMS1P54277 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMS1P54277 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMS1P54277 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS1P54277 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS1P54277 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS1P54277 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS1P54277 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS1P54277 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS1P54277 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS1P54277 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS1P54277 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS1P54277 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMS1P54277 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMS1P54277 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMS1P54277 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PMS1P54277 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMS1P54277 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMS1P54277 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMS1P54277 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMS1P54277 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMS1P54277 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMS1P54277 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PMS1P54277 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PMS1P54277 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMS1P54277 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMS1P54277 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMS1P54277 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMS1P54277 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMS1P54277 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMS1P54277 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMS1P54277 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMS1P54277 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PMS1P54277 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PMS1P54277 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PMS1P54277 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PMS1P54277 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PMS1P54277 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PMS1P54277 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS1P54277 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS1P54277 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS1P54277 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS1P54277 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS1P54277 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS1P54277 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS1P54277 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS1P54277 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS1P54277 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS1P54277 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS1P54277 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS1P54277 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS1P54277 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS1P54277 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS1P54277 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS1P54277 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS1P54277 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS1P54277 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS1P54277 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS1P54277 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS1P54277 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS1P54277 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS1P54277 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS1P54277 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS1P54277 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS1P54277 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS1P54277 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS1P54277 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS1P54277 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS1P54277 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMS1P54277 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMS1P54277 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMS1P54277 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMS1P54277 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMS1P54277 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMS1P54277 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMS1P54277 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMS1P54277 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMS1P54277 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMS1P54277 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMS1P54277 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMS1P54277 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMS1P54277 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMS1P54277 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMS1P54277 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS1P54277 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS1P54277 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms