Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ESR1P03372 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ESR1P03372 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ESR1P03372 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ESR1P03372 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ESR1P03372 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESR1P03372 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESR1P03372 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESR1P03372 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESR1P03372 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESR1P03372 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESR1P03372 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESR1P03372 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESR1P03372 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESR1P03372 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESR1P03372 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESR1P03372 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESR1P03372 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ESR1P03372 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESR1P03372 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESR1P03372 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ESR1P03372 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESR1P03372 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESR1P03372 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESR1P03372 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESR1P03372 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ESR1P03372 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESR1P03372 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESR1P03372 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESR1P03372 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESR1P03372 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESR1P03372 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESR1P03372 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESR1P03372 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESR1P03372 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESR1P03372 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESR1P03372 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESR1P03372 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESR1P03372 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ESR1P03372 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ESR1P03372 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESR1P03372 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESR1P03372 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESR1P03372 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESR1P03372 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESR1P03372 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESR1P03372 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESR1P03372 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ESR1P03372 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESR1P03372 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESR1P03372 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESR1P03372 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESR1P03372 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESR1P03372 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ESR1P03372 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESR1P03372 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESR1P03372 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESR1P03372 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESR1P03372 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESR1P03372 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESR1P03372 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESR1P03372 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESR1P03372 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ESR1P03372 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESR1P03372 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESR1P03372 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESR1P03372 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESR1P03372 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ESR1P03372 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ESR1P03372 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ESR1P03372 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ESR1P03372 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ESR1P03372 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ESR1P03372 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ESR1P03372 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ESR1P03372 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ESR1P03372 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ESR1P03372 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ESR1P03372 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ESR1P03372 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ESR1P03372 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ESR1P03372 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ESR1P03372 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESR1P03372 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESR1P03372 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESR1P03372 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESR1P03372 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESR1P03372 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESR1P03372 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESR1P03372 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESR1P03372 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ESR1P03372 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESR1P03372 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESR1P03372 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESR1P03372 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESR1P03372 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESR1P03372 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESR1P03372 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESR1P03372 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESR1P03372 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms