Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNE2O96020 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNE2O96020 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNE2O96020 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNE2O96020 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNE2O96020 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNE2O96020 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNE2O96020 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNE2O96020 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNE2O96020 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNE2O96020 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNE2O96020 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNE2O96020 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNE2O96020 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms