Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UTP11Q9Y3A2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.9 ms