Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LEMD3Q9Y2U8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LEMD3Q9Y2U8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
LEMD3Q9Y2U8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LEMD3Q9Y2U8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms