Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATAD3AQ9NVI7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATAD3AQ9NVI7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms