Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLSTN2Q9H4D0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSTN2Q9H4D0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN2Q9H4D0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms