Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM3Q9BZL3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms