Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COL24A1Q17RW2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL24A1Q17RW2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL24A1Q17RW2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
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