Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL19A1Q14993 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL19A1Q14993 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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