Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB1P08034 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB1P08034 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB1P08034 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB1P08034 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB1P08034 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB1P08034 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB1P08034 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB1P08034 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB1P08034 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB1P08034 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB1P08034 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB1P08034 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB1P08034 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB1P08034 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB1P08034 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB1P08034 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB1P08034 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB1P08034 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB1P08034 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB1P08034 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB1P08034 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB1P08034 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB1P08034 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB1P08034 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB1P08034 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB1P08034 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB1P08034 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB1P08034 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB1P08034 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB1P08034 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB1P08034 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB1P08034 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB1P08034 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB1P08034 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB1P08034 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB1P08034 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB1P08034 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB1P08034 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB1P08034 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB1P08034 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB1P08034 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB1P08034 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB1P08034 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB1P08034 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB1P08034 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB1P08034 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB1P08034 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB1P08034 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB1P08034 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB1P08034 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB1P08034 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB1P08034 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB1P08034 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB1P08034 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB1P08034 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB1P08034 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB1P08034 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB1P08034 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB1P08034 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB1P08034 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB1P08034 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB1P08034 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB1P08034 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB1P08034 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB1P08034 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB1P08034 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB1P08034 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB1P08034 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB1P08034 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB1P08034 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB1P08034 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB1P08034 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB1P08034 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB1P08034 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB1P08034 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB1P08034 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB1P08034 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB1P08034 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB1P08034 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB1P08034 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB1P08034 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB1P08034 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB1P08034 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB1P08034 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB1P08034 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB1P08034 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB1P08034 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB1P08034 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB1P08034 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB1P08034 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB1P08034 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB1P08034 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB1P08034 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB1P08034 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB1P08034 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB1P08034 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB1P08034 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB1P08034 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB1P08034 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms