Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGSF3O75054 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms