Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC11O43248 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC11O43248 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms