Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RBM42Q9BTD8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
RBM42Q9BTD8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms