Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGD4Q96M96 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms