Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPNS2Q96L46 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPNS2Q96L46 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPNS2Q96L46 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPNS2Q96L46 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPNS2Q96L46 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPNS2Q96L46 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPNS2Q96L46 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPNS2Q96L46 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPNS2Q96L46 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPNS2Q96L46 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPNS2Q96L46 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPNS2Q96L46 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPNS2Q96L46 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms