Protein–RNA interactions for Protein: Q8N878

FRMD1, FERM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD1Q8N878 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD1Q8N878 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD1Q8N878 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms